Câu chuyện của bộ phim bắt đầu khi Arata vô tình chạm vào "Hermes Apocrypha", Grimoire của Lilith. Đột nhiên, anh ta bị bao phủ bởi một ánh sáng trắng sáng, và một cô bé từ từ xuất hiện trước anh ta. Cô bé tự gọi mình là Lilim, và coi cả Arata và Lilith là bố mẹ cô. Đồng thời sự xuất hiện của cô bé đã làm thay đổi cả thế giới...